Dáng Hình Thanh Âm xoay quanh câu chuyện của Nishimiya Shouko, một cô bé bị điếc từ nhỏ. Khi chuyển trường vào lớp của Ishida Shouya, sự tò mò của cậu bé này đã dẫn đến việc bắt nạt Shouko vì tật khiếm thính của cô. Việc bắt nạt đã đi quá xa khi Shouko bị chảy máu tai và phải chuyển trường, để lại hậu quả nặng nề cho Shouya khi cả lớp tẩy chay và bắt nạt cậu.
Mãi đến khi bước vào cao trung, Shouya vẫn bị hành hạ và ân hận bởi những gì mình đã làm trong quá khứ. Cậu quyết định phải gặp lại Shouko một lần nữa để bù đắp lại những tổn thương mà cậu đã gây ra. Với mong muốn chân thành muốn làm bạn với Shouko, Shouya hy vọng có thể sửa chữa những sai lầm của mình.
Quá trình Shouya tìm cách kết nối lại với Shouko là hành trình đầy cảm xúc và sự trưởng thành. Cậu phải đối mặt với những hậu quả của hành động quá khứ và học cách chuộc lỗi, không chỉ với Shouko mà còn với chính bản thân mình.