Quán Trọ Bách Quỷ (Phần 2) tiếp tục câu chuyện về Aoi, một cô sinh viên có khả năng nhìn thấy linh hồn, một năng lực thừa hưởng từ người ông quá cố của mình. Không chỉ vậy, Aoi còn là một người rất giỏi nấu ăn, với tài nghệ nấu bếp siêu hạng.
Cuộc đời Aoi có một bước ngoặt lớn khi cô bị bắt cóc bởi một vị thần, người cũng là chủ của nhà trọ Tenshinya. Vị thần này tuyên bố rằng Aoi phải trở thành vợ của hắn ta để trả món nợ mà ông của cô đã nợ.
Aoi từ chối cái điều mà cô cho là vô lý và quyết định sẽ trả món nợ thay cho ông mình bằng cách làm việc tại Tenshiya. Cô chấp nhận thử thách và bắt đầu cuộc sống mới tại nhà trọ này, nơi mà cô phải đối mặt với nhiều điều bất ngờ và thú vị.
Tại đây, Aoi sử dụng khả năng nấu ăn của mình để phục vụ các vị khách là những linh hồn, và dần dần, cô tìm thấy ý nghĩa của cuộc sống và cách để kết nối với những người xung quanh mình.